O Mount Sinai Health System iniciou um esforço esta semana para construir um vasto banco de dados de informações genéticas de pacientes que podem ser estudados por pesquisadores – e por uma grande empresa farmacêutica.
O objetivo é buscar tratamentos para doenças que variam de esquizofrenia a doenças renais, mas o esforço para coletar informações genéticas de muitos pacientes, coletadas durante coletas de sangue de rotina, também pode gerar preocupações com a privacidade.
Os dados serão tornados anônimos, e o Mount Sinai disse que não tinha intenção de compartilhá-los com ninguém além de pesquisadores. Mas bancos de dados de consumidores ou genealógicos cheios de informações genéticas, como Ancestry.com e GEDmatch, têm sido usados por detetives em busca de pistas genéticas que possam ajudá-los a resolver crimes antigos.
Vastos conjuntos de sequências genéticas podem revelar novos insights sobre muitas doenças e também abrir caminho para novos tratamentos, dizem pesquisadores do Mount Sinai. Mas a única maneira de compilar esses bancos de dados de pesquisa é primeiro convencer um grande número de pessoas a concordar em ter seus genomas sequenciados.
Além de perseguir o próximo medicamento inovador, os pesquisadores esperam que o banco de dados, quando combinado com os registros médicos dos pacientes, forneça novos insights sobre como a interação entre fatores genéticos e socioeconômicos – como pobreza ou exposição à poluição do ar – pode afetar a saúde das pessoas.
“Isso é realmente transformador”, disse Alexander Charney, professor da Escola de Medicina Icahn em Mount Sinai, que supervisiona o projeto.
O sistema de saúde espera eventualmente acumular um banco de dados de sequências genéticas para 1 milhão de pacientes, o que significaria a inclusão de aproximadamente um em cada 10 moradores de Nova York. O esforço começou esta semana, disse uma porta-voz do hospital, Karin Eskenazi.
Esta não é a primeira tentativa do Monte Sinai de construir um banco de dados genético. Por cerca de 15 anos, o Monte Sinai vem construindo lentamente um banco de amostras biológicas, ou biobanco, chamado BioMe, com cerca de 50.000 sequências de DNA até agora. No entanto, os pesquisadores ficaram frustrados com o ritmo lento, que atribuem ao processo complicado que usam para obter consentimento e inscrever pacientes: várias pesquisas e uma longa discussão individual com um funcionário do Mount Sinai que às vezes dura 20 minutos, de acordo com o Dr. Girish Nadkarni de Mount Sinai, que está liderando o projeto junto com o Dr. Charney.
A maior parte desse processo de consentimento está indo pelo caminho. O Monte Sinai abandonou as pesquisas de saúde e resumiu o procedimento à observação um vídeo curto e fornecendo uma assinatura. Esta semana começou a tentar inscrever a maioria dos pacientes que estavam recebendo exames de sangue como parte de seus cuidados de rotina.
Uma série de grandes programas de biobancos já existem em todo o país. Mas aquele que o Mount Sinai Health System está tentando construir seria o primeiro em grande escala a atrair participantes principalmente da cidade de Nova York. O programa pode muito bem marcar uma mudança na forma como muitos nova-iorquinos pensam sobre suas informações genéticas, de algo privado ou desconhecido para algo que doaram para pesquisa.
O projeto envolverá o sequenciamento de um grande número de amostras de DNA, um empreendimento que pode custar dezenas ou mesmo centenas de milhões de dólares. Para evitar esse custo, o Mount Sinai fez uma parceria com a Regeneron, uma grande empresa farmacêutica, que fará o trabalho real de sequenciamento. Em troca, a empresa terá acesso às sequências genéticas e registros médicos parciais de cada participante, de acordo com os médicos do Mount Sinai que lideram o programa. O Monte Sinai também pretende compartilhar dados com outros pesquisadores.
Embora os pesquisadores do Mount Sinai tenham acesso a registros de saúde eletrônicos anônimos de cada paciente que participa, os dados compartilhados com Regeneron serão mais limitados, de acordo com o Mount Sinai. A empresa pode acessar diagnósticos, laudos laboratoriais e sinais vitais.
Quando combinados com registros de saúde, grandes conjuntos de dados genéticos podem ajudar os pesquisadores a procurar mutações raras que têm uma forte associação com uma determinada doença ou podem proteger contra ela.
Resta saber se o Monte Sinai, um dos maiores sistemas hospitalares da cidade, pode atingir sua meta de inscrever um milhão de pacientes no programa, que o hospital está chamando de “’Mount Sinai Million Health Discover Programme’”. Se isso acontecer, o banco de dados resultante estará entre os maiores do país, ao lado de um administrado pelo Departamento de Assuntos de Veteranos dos EUA, bem como um projeto administrado pelos Institutos Nacionais de Saúde que tem o objetivo de inscrever 1 milhão de americanos, embora é atualmente muito curto.
(Esses dois projetos governamentais envolvem o sequenciamento do genoma completo, que revela a composição completa do DNA de um indivíduo; o projeto do Monte Sinai sequenciará cerca de 1 por cento do genoma de cada indivíduochamado de exoma.)
A Regeneron, que nos últimos anos se tornou amplamente conhecida por seu tratamento eficaz de anticorpos monoclonais para Covid-19, sequenciou e estudou o DNA de aproximadamente 2 milhões de “pacientes voluntários”, principalmente por meio de colaborações com sistemas de saúde e um grande biobanco na Grã-Bretanha, de acordo com o relatório. a empresa.
Mas o número de pacientes que o Mount Sinai espera inscrever – juntamente com sua diversidade racial e étnica, e a da cidade de Nova York em geral – o diferencia da maioria dos bancos de dados existentes.
“A escala e o tipo de descobertas que todos poderemos fazer é bem diferente do que é possível até hoje com estudos menores”, disse o Dr. Aris Baras, vice-presidente sênior da Regeneron.
Pessoas de ascendência europeia são tipicamente super-representadas em conjuntos de dados genômicos, o que significa, por exemplo, que os testes genéticos que as pessoas fazem para risco de câncer são muito mais sintonizados com variantes genéticas comuns entre pacientes brancos com câncer, disse Baras.
“Se você não tem ascendência europeia, há menos informações sobre variantes e genes e você não vai conseguir um teste genético tão bom como resultado disso”, disse Baras.
O Mount Sinai Health System, que tem sete hospitais na cidade de Nova York, atende cerca de 1,1 milhão de pacientes individuais por ano e atende mais de 3 milhões de consultas ambulatoriais em consultórios médicos. Dr. Charney estimou que o sistema hospitalar estava coletando o sangue de pelo menos 300.000 pacientes anualmente, e ele esperava que muitos deles consentissem em ter seu sangue usado para pesquisa genética.
A taxa de inscrição para essa coleta de dados geralmente é alta – cerca de 80%, disse ele. “Então a matemática confere. Devemos ser capazes de chegar a um milhão.”
Mark Gerstein, professor de Informática Biomédica da Universidade de Yale, disse que não há dúvida de que os conjuntos de dados genômicos estão impulsionando grandes descobertas médicas. Mas ele disse que ainda não participaria de um e pediu às pessoas que considerem se adicionar seu DNA a um banco de dados algum dia afetará seus netos.
“Eu tendo a ser um preocupado”, disse ele.
Nosso conhecimento coletivo de mutações e a quais doenças elas estão associadas – seja Alzheimer ou esquizofrenia – só aumentaria nos próximos anos, disse ele. “Se os conjuntos de dados vazarem algum dia, a informação pode ser usada para discriminar os filhos ou netos dos participantes atuais”, disse Gerstein. Eles podem ser provocados ou ter o seguro negado, acrescentou.
Ele observou que, mesmo que os dados fossem anônimos e seguros hoje, isso poderia mudar. “Proteger as informações por longos períodos de tempo fica muito mais difícil”, disse ele, observando que o Regeneron pode nem existir em 50 anos. “O risco de os dados serem invadidos por um período tão longo aumenta”, disse ele.
Outros médicos pediram a participação, observando que a pesquisa genética oferece uma grande esperança para o desenvolvimento de tratamentos para uma série de doenças. Dr. Charney, que irá supervisionar o esforço para reunir um milhão de sequências, estuda a esquizofrenia. Ele usou o banco de dados existente do Mount Sinai para procurar uma variante genética específica associada à doença psicótica.
Dos três pacientes no banco de dados existente do Mount Sinai BioMe com essa variante, apenas um teve uma doença psicótica grave ao longo da vida. “O que há nos genomas dessas outras duas pessoas que de alguma forma as protegeram, ou talvez seja o ambiente que as protegeu?” ele perguntou.
Sua equipe começou a chamar esses pacientes para pesquisas adicionais. O plano é coletar amostras de suas células e usar a tecnologia de edição de genes para estudar o efeito de várias mudanças nessa variante genética específica. “Essencialmente, o que estamos dizendo é: ‘o que é esquizofrenia em um prato?’” Tentando responder a essa pergunta, disse Charney, “pode ajudá-lo a entender qual é o processo real da doença”.
Wilbert Gibson, 65, está inscrito no banco de dados genético existente do Mount Sinai. Saudável até os 60 anos, seu coração começou a falhar rapidamente, mas os médicos inicialmente lutaram com um diagnóstico. No Monte Sinai, ele descobriu que sofria de amiloidose cardíaca, na qual a proteína se acumula no coração, reduzindo sua capacidade de bombear sangue.
Ele recebeu um transplante de coração. Quando lhe perguntaram se compartilharia seu genoma para ajudar na pesquisa, ele concordou. Ele foi incluído na pesquisa genética que ajudou a identificar uma variante de gene em pessoas de ascendência africana ligada à doença cardíaca. Participar de pesquisas médicas foi a decisão mais fácil que ele enfrentou na época.
“Quando você está na situação em que estou e descobre que seu coração está falhando e tudo está acontecendo tão rápido, você vai e faz”, disse ele em uma entrevista na qual creditou aos médicos do Monte Sinai a salvação de seu vida.
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